首先，小型孵化機需要安裝在混凝土地面上，地面應保持平整，安裝時小型孵化機應稍向前傾斜，以便于清洗時排放污水，機門前要留2至3米的操作空間。
其次，小型孵化機孵化室的溫度應保持在20至 27攝氏度，溫度高于27攝氏度或低于20攝氏度時，應考慮安裝空調設備或采取其他措施。濕度應保持在百分之50左右。室內要有良好的通風換氣條件，孵化機(特別是出雛機腓出的廢氣要用管道引至室外。小型孵化機孵化室要經常清掃、沖洗、粉刷和消毒。
第三，小型孵化機安裝完畢后要通電試機，檢查溫度、濕度控制系統是否正常，并根據要求調好溫度。還要檢查超溫、低溫報警系統、自動定時翻蛋系統，待運轉1至2天，正常后方可正式入孵。
第四，小型孵化機使用時要注意機門上溫度計指示的溫度，如有不正常，要及時予以排除。
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